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rosetta是一套用于模擬大分子結構的綜合軟件。最早與1998年用FORTRAN編寫,用于對小蛋白進行abinitio預測。現在已經用C++重寫,作為一種靈活、多用途的應用,它包括蛋白質和核酸的結構預測、設計和重塑工具。Rosetta的web服務器已經運行了數十億的結構預測和蛋白質設計模擬。
Rosetta的web服務器已經運行了數十億的結構預測和蛋白質設計模擬,還有數十億甚至數萬億運行在超級計算機集群上。
研究人員利用Rosetta來更好地了解傳染病、癌癥和自身免疫性疾病的治療方法。進一步的應用包括開發疫苗、新材料、靶向蛋白粘合劑和酶設計。
Rosetta最初是一個結構預測工具,在 CASP 社區范圍內的盲預測訓練中一直表現出色。它已經成長為提供多種有效的采樣算法來探索主鏈、側鏈和序列空間,其優點已經推廣到包括 RNA-puzzles 和 CAPRI 在內的更多社區范圍的練習中。羅塞塔擁有廣泛測試的能量評分功能,包含從折疊到對接到設計的無與倫比的應用范圍。
Rosetta 可以免費提供給學術和政府實驗室,已經有超過10000個免費許可證在使用。還包括一個活躍的論壇。要下載Rosetta,請申請許可證。
如果你已經準備好給試一試Rosetta,建議從這里開始嘗試這些教程。