rosetta是什么軟件?

rosetta是一套用于模擬大分子結(jié)構(gòu)的綜合軟件。最早與1998年用FORTRAN編寫(xiě)，用于對(duì)小蛋白進(jìn)行abinitio預(yù)測(cè)。現(xiàn)在已經(jīng)用C++重寫(xiě)，作為一種靈活、多用途的應(yīng)用，它包括蛋白質(zhì)和核酸的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、設(shè)計(jì)和重塑工具。Rosetta的web服務(wù)器已經(jīng)運(yùn)行了數(shù)十億的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)模擬。

Rosetta的web服務(wù)器已經(jīng)運(yùn)行了數(shù)十億的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)模擬，還有數(shù)十億甚至數(shù)萬(wàn)億運(yùn)行在超級(jí)計(jì)算機(jī)集群上。

研究人員利用Rosetta來(lái)更好地了解傳染病、癌癥和自身免疫性疾病的治療方法。進(jìn)一步的應(yīng)用包括開(kāi)發(fā)疫苗、新材料、靶向蛋白粘合劑和酶設(shè)計(jì)。

Rosetta最初是一個(gè)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具，在 CASP 社區(qū)范圍內(nèi)的盲預(yù)測(cè)訓(xùn)練中一直表現(xiàn)出色。它已經(jīng)成長(zhǎng)為提供多種有效的采樣算法來(lái)探索主鏈、側(cè)鏈和序列空間，其優(yōu)點(diǎn)已經(jīng)推廣到包括 RNA-puzzles 和 CAPRI 在內(nèi)的更多社區(qū)范圍的練習(xí)中。羅塞塔擁有廣泛測(cè)試的能量評(píng)分功能，包含從折疊到對(duì)接到設(shè)計(jì)的無(wú)與倫比的應(yīng)用范圍。

Rosetta 可以免費(fèi)提供給學(xué)術(shù)和政府實(shí)驗(yàn)室，已經(jīng)有超過(guò)10000個(gè)免費(fèi)許可證在使用。還包括一個(gè)活躍的論壇。要下載Rosetta，請(qǐng)申請(qǐng)?jiān)S可證。

如果你已經(jīng)準(zhǔn)備好給試一試Rosetta，建議從這里開(kāi)始嘗試這些教程。